医疗机构的HIS系统（医院信息系统）收费方式通常包括以下几个方面：
1. 软件费用：
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购买费用：医疗机构一次性购买HIS软件，费用通常包括软件本身的费用以及售后服务费用。
租赁费用：医疗机构按照使用年限或使用周期支付软件租赁费用。
2. 实施费用：
项目实施费用：包括系统实施、调试、培训等费用。
硬件费用：如果医疗机构需要采购服务器、工作站等硬件设备，这部分费用也会计算在内。
3. 维护费用：
年度维护费：医疗机构每年需要支付一定的维护费用，以确保系统的正常运行和升级。
升级费用：软件升级时，可能需要支付一定的升级费用。
4. 定制开发费用：
如果医疗机构需要根据自身业务特点定制开发特定的功能模块，这部分费用也会被单独计算。
5. 其他费用：
数据迁移费用：如果医疗机构需要将旧系统中的数据迁移到新系统，可能会产生数据迁移费用。
咨询服务费用：在系统实施过程中，可能会聘请第三方顾问提供咨询服务，产生咨询服务费用。
具体的收费标准和方式可能会因不同地区、不同供应商以及不同医疗机构的需求而有所不同。一般来说，医疗机构在选择HIS系统时，会与供应商进行详细的沟通，明确各项费用和支付方式。以下是一些常见的收费方式：
按年收费：根据系统维护和升级服务按年收费。
按项目收费：根据实际实施的项目和需求进行收费。
按用户数收费：根据实际使用系统的用户数量进行收费。
按服务时长收费：根据系统实施、调试、培训等服务的时长进行收费。
在选择HIS系统时，医疗机构应综合考虑自身需求、预算以及供应商的服务质量等因素，选择最合适的收费方式和供应商。
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