土木工程一级学科下设有多个二级学科，以下是其中一些主要的二级学科：
1. 建筑学
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2. 建筑设计及其理论
3. 建筑历史与理论
4. 建筑技术科学
5. 建筑环境与设备工程
6. 建筑电气与智能化
7. 防灾减灾工程及防护工程
8. 土木工程
9. 城市地下空间工程
10. 市政工程
11. 道路桥梁与渡河工程
12. 桥梁与隧道工程
13. 交通运输规划与管理
14. 交通信息工程及控制
15. 港口、海岸及近海工程
16. 供热、供燃气、通风及空调工程
17. 建筑与土木工程
18. 水工结构工程
19. 水利水电工程
20. 水利水电工程建筑
21. 水利水电工程管理
22. 水文与水资源工程
23. 水文与水资源
24. 环境工程
25. 环境科学与工程
26. 地下水科学与工程
27. 地质工程
28. 地质工程与地质信息工程
29. 地球探测与信息技术
30. 地球物理学与勘查技术
31. 测绘工程
32. 测绘科学与技术
33. 生态工程
34. 矿业工程
35. 矿物加工工程
36. 矿物加工工程（矿物加工工程）
37. 矿物加工工程（选矿工程）
38. 矿物加工工程（矿物加工机械）
39. 矿物加工工程（采矿工程）
40. 矿物加工工程（安全技术及工程）
41. 矿物加工工程（矿井建设）
42. 矿物加工工程（安全技术及工程）
43. 矿物加工工程（矿山机械）
44. 矿物加工工程（安全技术及工程）
45. 矿物加工工程（矿山工程）
46. 矿物加工工程（安全技术及工程）
47. 矿物加工工程（矿山地质）
48. 矿物加工工程（安全技术及工程）
49. 矿物加工工程（矿山电气）
50. 矿物加工工程（安全技术及工程）
这些二级学科涵盖了土木工程领域的各个方面，从建筑设计到施工技术，从城市规划到环境工程，从水利工程到交通运输等。每个二级学科都有其独特的研究方向和教学内容。
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